Das Graduierten-Progamm Experimentelle Medizin ermöglicht Promovierenden eine umfassende Weiterbildung und bestmögliche Förderung ihrer Projekte. Beispielsweise werden die Kollegiaten neben dem Doktorvater/der Doktormutter zusätzlich durch einen Co-Betreuer unterstützt, der weitere Aspekte in das Projekt einbringen kann.

Das IZKF lädt seit 2010 jedes Jahr Nachwuchswissenschaftler/innen aus der ganzen Welt ein, um an der Summer School Molecular Medicine teilzunehmen. Hier wird die einzigartige Möglichkeit gegeben, sich mit den Forschungsthemen der Molekularen Medizin in Jena vertraut zu machen und moderne Labortechniken zu erlernen.