Struktur
Das ZSE ist ein interdisziplinärer Zusammenschluss von Kliniken und Instituten des Universitätsklinikums Jena.
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A-Zentrum
Das A-Zentrum ist die Dachorganisation des ZSE. Es umfasst die Sprecher des Vorstands und das Koordinationsbüro bestehend aus Koordinator und ärztlichen Lotsen. Der Koordinatorenstelle obliegt die Leitung des A-Zentrums (administrative Geschäftsführung). Ärztliche Lotsen sind an der Schnittstelle vom Patienten zu den Spezialisten der B-Zentren am UKJ oder anderen Einrichtungen als Behandler seltener Erkrankungen tätig.
B-Zentrum
In den B-Zentren findet die fachspezifische Betreuung der Patienten statt. Sie bieten Spezialsprechstunden an und organisieren damit den Erstkontakt mit den Patienten.