SepSys

Systembiologie der Sepsis

Unser Ziel ist, systembiologische Modelle zu entwickeln, um

1. Moleküle, Signal- und Stoffwechselwege zu finden, die für die ungebundene Entzündungsantwort bei Sepsis relevant sind, damit sollen
2. die molekularen Mechanismen entschlüsselt werden,
3. Biomarker für die Frühdiagnose bestimmt werden, und
4. spezifische Wirkstofftargets identifiziert werden.

Um das zu erreichen, werden neue Methoden entwickelt und molekulare Hochdurchsatzdatensätze von Sepsispatienten und Tiemodellen integriert, wie z.B. Genexpressions-, genomische, metabolomische, Proteomics- und Sequenzierdaten. Wir werden Modelle entwickeln, mit denen die Regulation von Signal und Stoffwechselwegen in verschiedenen Organen beobachtet werden kann. Wir analysieren die mögliche Auswirkung genetischer Varianten auf den klinischen Verlauf der Sepsis. Im speziellen sollen Varianten die zu Proteinfehlfunktion führen, in Patienten mit unerwartet gutem klinischen Verlauf gefunden werden, da diese Varianten auf potenzielle Wirkstofftargets schließen lassen. Methodisch werden wir genregulatorische Modelle für Signalwege und Stoffwechselwege entwickeln und diese Modelle verknüpfen, um die spezifische Regulation der betroffenen Zellen zu charakterisieren. Zusätzlich werden wir statistische Abhängigkeitsmodelle entwickeln, um die Regulation der verschiedenen Organe zu verbinden und um wichtige Mediator-Moleküle zu finden. Diese Moleküle können auf als potenzielle Wirkstofftargets dienen. Unsere Vorhersagen sollen experimentell von unseren CSCC Kooperationspartner validiert werden.