Ein Internes Gutachtergremium (Internal Review Board, IRB) begutachtet Projektanträge anhand der wissenschaftlichen Qualität und dem klinischen Nutzen und berät den Vorstand zu deren Förderung. Die Mitglieder des IRB repräsentieren alle Forschungsfelder des CSCC; sie gehören dem CSCC, dem UKJ oder der Friedrich-Schiller-Universität an oder arbeiten an kooperierenden Instituten der Leibniz-Gemeinschaft.
Der Externe Wissenschaftliche Beirat (Scientific Advisory Board, SAB) mit national und international anerkannten Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern auf dem Gebiet der Sepsis- und Infektionsforschung besteht aus 14 Mitgliedern. Das SAB trifft sich regelmäßig, um Entwicklung und Qualität der Arbeit des CSCC, wie klinische und Grundlagen-Forschung, Ausbildung, Struktur und Nachhaltigkeit, zu bewerten und zu kontrollieren. Er beurteilt die wissenschaftlichen Leistungen und berät den Vorstand und die Mitglieder bei der mittel- und langfristigen Projektplanung. Der Externe Wissenschaftliche Beirat empfiehlt dem Projektträger (DLR) die Vergabe von Mitteln für neue Projekte und klinische Studien anhand der wissenschaftlichen Qualität und dem klinischen Nutzen und kann bei wesentlichen Entscheidungen zu finanziellen Aspekten beraten.