Die seit über 200 Jahren bestehende Lehr- und Forschungssammlung der Jenaer Anatomie befindet sich in zwei Räumen, die zu dem historisch ältesten Gebäude der Universität gehören, dem Collegium Jenense, einem ehemaligen Dominikanerkloster. Die Dauerausstellung der Sammlung wird vom Institut für Anatomie betreut. Sie ist seit Juni 2022 für die allgemeine Öffentlichkeit geöffnet.

Im vorderen sogenannten Rolfinck-Saal wird die menschliche Anatomie nach Organsystemen erklärt. In neu gestalteten Vitrinen können ausgewählte Exponate ihre ganze Wirkung entfalten, wozu auch eine 2021 neu installierte LED-Beleuchtung beiträgt. Hier sind auch moderne plastinierte Präparate zu sehen, die am Institut für Anatomie in den letzten Jahren angefertigt wurden. Sie werden durch historische Trockenpräparate und anatomische Modelle ergänzt. Dieser Saal kommt dem Interesse an der Anatomie des menschlichen Körpers entgegen und eignet sich insbesondere zu Unterrichtszwecken. Ein besonderer Bereich gibt Auskunft über verschiedene Präparationstechniken. Ausführlich wird zudem die Frage nach der Herkunft der Anatomieleichen zu verschiedenen Zeiten beleuchtet.

In dem nach Goethe benannten zweiten Ausstellungsraum wird die historische Bedeutung der Anatomischen Sammlung erfahrbar. Hier sind die ältesten Präparate aus der Gründungszeit ebenso zu sehen wie Exponate, die an die vergleichenden anatomischen Studien Johann Wolfgang von Goethes erinnern, zum Beispiel an den Zwischenkiefer-Knochen. Auch die spätere Sammlungsgeschichte und die um 1857 eingerichtete „Raçenschädel“-Sammlung werden thematisiert. Einen zweiten großen Schwerpunkt setzt die Ausstellung in diesem Saal auf der historischen Modellsammlung. Gezeigt wird eine Vielfalt an anatomischen Modellen, darunter kunstvolle Wachsmodellserien zur Embryologie.

Homepage der Anatomischen Sammlung