Zentren am Universitätsklinikum Jena
- Integriertes Forschungs- und Behandlungszentrum "Center for Sepsis Control and Care"
- Zentrum für Innovationskompetenz "Septomics"
- UniversitätsTumorCentrum
- Zentrum für klinische Studien
- Forschungszentrum Lobeda
- Interfakultäres Zentrum für Molekulare Biomedizin
- Interdisziplinäres Zentrum für Klinische Forschung (IZKF)
- Biomagnetisches Zentrum
- Mitteldeutsches Kopfschmerzzentrum
- Zentrum für Ambulante Medizin
- Zentrum für Infektionsmedizin und Krankenhaushygiene
- Zentrum für Zahn-, Mund- und Kieferheilkunde